针对单位员工反复请假做试管婴儿的情况，用人单位在处理时应遵循相关法律法规，确保员工权益的同时，也维护单位的正常运营秩序。以下是对此问题的详细解答：
一、女员工请假做试管婴儿的权益保障
根据《女职工劳动保护特别规定》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期期间享有特殊的劳动保护。虽然该规定并未直接涉及试管婴儿的情况，但试管婴儿过程中的相关医疗行为，如取卵、移植等，往往被视为女职工生育医疗的一部分。因此，在女员工因进行试管婴儿而请假时，用人单位应给予一定的理解和支持，不得以此为由降低其工资、予以辞退或解除劳动或聘用合同。
二、请假与单位规章制度的关系
虽然女员工因试管婴儿请假享有合法权益，但这并不意味着她们可以无限制地请假。请假行为仍需遵守单位的规章制度，如请假程序、请假时长等。如果女员工的请假行为严重违反了单位的规章制度，如未经批准擅自延长假期、频繁请假影响工作进度等，用人单位有权依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，解除劳动合同。
三、合理处理女员工反复请假做试管婴儿的建议
建立完善的请假制度：用人单位应制定明确的请假政策，包括请假条件、程序、时长及审批流程等，确保员工在请假时有明确的依据。
加强沟通与理解：对于因试管婴儿而反复请假的女员工，用人单位应与其进行充分沟通，了解其实际需求和困难，并尽可能给予支持和帮助。
弹性工作安排：在条件允许的情况下，用人单位可以考虑为因试管婴儿而请假的女员工提供弹性工作安排，如调整工作时间、工作地点或工作任务等，以减轻其工作压力。
依法处理违规行为：对于严重违反请假制度或其他规章制度的女员工，用人单位在充分调查取证后，可依法采取相应的处理措施。
综上所述，单位在处理员工反复请假做试管婴儿的问题时，应兼顾员工权益和单位利益，遵循相关法律法规，采取合理有效的措施。